סידור הגנום השחור של הקרנף יכול להציל את המינים מהכחדה

המאה ה -21 הוא זמן נפלא להיות bioengineer וזמן נורא להיות קרנף שחור. המינים האפריקאים, שמספרם הגיע לכ- 850,000 לפני מאה שנה, הופנו לאוכלוסייה ההולכת ומתמעטת בסביבות 5,000. בתקווה של יום אחד rewinding זו ירידה קטסטרופלי, ביולוגים מנסים למצות את רצף של diceros bicornis bicornis גנום.

הפרויקט הוא מאמץ משותף בין כמה מומחים בתחום הביוטכנולוגיה שימור דעת, כולל הפתולוג של אוניברסיטת וושינגטון ו ביו-הנדסה ד"ר צ'רלס מאריי ומתיו מרקוס, מנכ"ל Pembient. פמביינט היא חברת ביוטכנולוגיה של סן פרנסיסקו שרוצה להציף את השווקים הסיניים עם קרן סינתטית - אך זהה מבחינה ביולוגית - קרנף, 3D מודפס מקרטין מעבדה ואולי מועבר כמו בירה קרנף. (קראטין הוא החומר שציפורניך וקרני הקרנף עשויות ממנו הוא אינו קסום ולא מרפא). פמביינט יכול ללמוד מספיק מגנום של קרנף יחיד בשם נטומבי, אמר מרקוס הפוך, כדי לחדד את הדרך בה הוא מסנתז חלבונים קרנף.

אבל לפני שמישהו יכול שלי גנטיקה של נטומבי עבור נתונים, הגנום הקרנף השחור צריך להיות רצף הראשון. הפרויקט הוא בערך במחצית הדרך לגייס 16,500 $ על Experiment.com, פלטפורמת קהל ההוצאות כמו Kickstarter למעט מדע במקום להחיות משחקי וידאו מתים.

"יש עדיין אורגניזמים מעטים יחסית שהגנום שלהם נסרק", אומר מוריי. "עד לא מזמן זה היה מאוד קשה - זמן רב ויקר."

זה לא אומר שחיות לא מקבלות את הגנום שלהן. פרויקט הגנום 10K שואף לאסוף תיבת נח של נתונים גנטיים. והקרנף הלבן הדרומי, מינים מאוכלסים וגדולים יותר, היה הגנום שלו רצוף בשנת 2012. אבל מה עם קרנפים שחורים כמו Ntombi? "לא ברור למה הקרנף השחור נשאר בצד כל כך הרבה זמן", אומר מרקוס. הוא גיר את המחדל עד לקרות; אבל זה יכול להיות, כי הלבנים הדרומיים כבר כבר רצף, הקרנף השחור לא היה בראש סדר העדיפויות.

מרקוס, מורי, ומשתפי הפעולה שלהם שואפים לחבר את הפער הזה. נטומבי, קרנף כרזה לפרויקט, כבר היה דם נמשך ושמר - ו, בינגו! קרנף DNA. רצף צריך להיות פשוט למדי, אמר מורי. "זה עוזר גדול יש את הגנום הקרנף לבן כמו אמת מידה."

השלבים הבאים ברצף

עם הדנ"א של נטומבי המתארח על שרתי הדנ"א, הביולוגים יניחו את היסודות לגנומיקה השוואתית של הקרנף. "ברגע שאנחנו מקבלים את הרצף שלה אנחנו יכולים להתחיל להבין מה עושה קרנף קרנף, איך הלבן שונה מן השחור," אומר מורי, "ולספק מידע שיסייע לעקוב אחר דגימות פרושות."

וטרינרים יכולים לבדוק אם קיימים גנים שעלולים לגרום למחלה, ויש להם בסיס להשוואת שבעת תת-שבעת הקרנפים השחורים - שלושה מהם כבר נכחדו.

החיות אחרי מחר

ברגע שיש לנו הבנה מוצקה יותר של הגנום שחור הקרנף, כמה דלתות תיאורטיות פתוח. "בהמשך הדרך אני מתרגש משימוש בתאי גזע כדי להבין פיזיולוגיה של הקרנף, וכמובן, לגדל קרני קרנף במעבדה כדי להפחית את הציד," אומר מוריי.

מרקוס מעריך קצת יותר. ל diceros bicornis bicornis, מרקוס אינו רואה כל כך הרבה הכחדה בסגנון ממותה, אלא מסובב את השעון הגנטי; ככל שהאוכלוסיות הקטנות יותר, כך הן נוטות יותר לרשת את הבעיות.

ובשביל הקרנפים השחורים שנעלמו? הוא משווה את המאמץ עם זה של רצף הגנום הקרנף לבן לבן, פרויקט מתמשך בגן החיות בסן דייגו. יש דיבורים על ניסיון להשיג קרנף לבן דרומי (מתוכו 20,000) לשאת קרנף לבן לבן (מתוכו יש 5). מרקוס מדבר באופטימיות זהירה זהירה: "פוטנציאל - פוטנציאל - אולי התת-קרקעות השחורות שנכחדו יכול להיווצר לחיים".